Малдер, Скалли и Секретные Материалы. В 1991 году "призрачный" Фокс Малдер прошел сеанс регрессивного гипноза, в результате чего восстановил свои воспоминания о похищении сестры Саманы. Фокс закончил Оксфордский университет и был отличным агентом ФБР. (Pilot) Не только воспонимания о похищении сестры стали причиной его заинтересованности паранормальными явлениями, этому способствовали еще два инцидента. В 1989 году он познакомился с Одинокими Стрелками, которые рассказыли ему о правительственных экспериментах над людьми. (Unusual Suspects) А в 1990 году он узнал о том, что отец участвовал в экспериментах по трансплантации инопланетных тканей человеку. (Travelers) После того, как он подвергся регрессивному гипнозу, и убедился в существовании внеземной жизни, он бросает свою перспективную карьеру в отделе насильственных преступлений и просит назначения в "Секретные материалы (X-Files)", архив нераскрытых и необъяснимых дел. Он начинает работать над X-Files c Дианой Фоули (Diana Fowley), его возлюбленной со времен учебы в Академии ФБР. Она была одной из тех, кто рекомендовал ему подвергнуться гипнозу. Несколько лет спустя Малдер начал скептически относится к внеземной жизни, когда человек из Министерства Обороны, по имени Майкл Кричгау (Michael Kritschgau), сказал ему, что все это дело - мистификация, созданная правительством для отвлечения общественного внимания на другие вещи. Малдер стал "пешкой", контролируемый тщательно разработанными планами правительства, по словам Кричгау. Он сказал ему, что кроме этой мистификации, эти же люди ответственны за рак Скалли. Ее заразили раком, чтобы он поверил. Лабораторные тесты доказали, что ДНК, найденная в фальшивом теле пришельца, та же самая, что в раковой опухоли Скалли. Истина, однако, в том что некоторые вещи реальны, а некоторые - нет. Члены правительства, которые знают о Синдикате, фактически скрывают такие вещи, как Проект, что Малдер и осознал после того как стал свидетелем корабля в Антарктике. (Fight the Future, The Beginning) X-Files начались, когда секретарь ФБР в ранние 50-е годы начала составлять картотеку этих необъяснимых дел под буквой "U". Когда место в картотеке закончились, она начала составление их под "X". Первый X-File был занесен в картотеку ни кем иным как самим Дж. Эдгаром Гувером (J. Edgar Hoover). (Shapes, Travelers) X-Files, естественно, содержали файлы об операциях Синдиката и о Саманте. Другие были добавлены после того, как Малдер их обнаружил. Курильщик сжег X-Files спустя 5 лет после назначения Скалли в X-Files к Малдеру, оставив дело Саманты себе. Святой для Малдера плакат "Я хочу верить" сгорел в огне. Он получил новый плакат на замену от друга-ветеринара, с которой познакомился по электронной почте. Она была убита в инциденте, не связанном с основной сюжетной линией. (The End, Alpha)
Дана Кэтрин Скалли (Dana Katherine Scully) была назначена в напарницы к Малдеру шефом секции Блевинсом (Blevins), который был затем убит людьми, к которым относился слишком лояльно, - Синдикатом. (Pilot, Gethsemane, Redux, Redux II) Ее назначение должно было быть направлено против "вздорности" работы Малдера - должно было подвергнуть его выводы научной проверке. В результате своего похищения и другого опыта она начинает "верить". У них с Малдером развиваются хорошие взаимоотношения, и они верят только друг другу. Скалли оканчивает с отличием медицинский колледж и вербуется в ФБР, пытаясь таким образом сделать что-то важное для своей страны, "почувствовать разницу". Теперь же только X-Files и Малдер - вот все, что ее здесь интересует.
